Можно, если осторожно.
Запускаешь SP2, вставляешь диск с SP3 и устанавливаешь как бы поверх.
Здесь это сложно расписать, но в общем реально поставить поверх без потери данных.
Это неофициальный пакет обновлений, выпущенных MS после релиза SP3, собранный в единое целое инженерами-любителями. Содержимое его может быть весьма разнообразным и непредсказуемым.