Можно еще ссылочки оформить через сервисы сокращения ссылок (это куда удобней), например, через 6link.ru или u.to (и там, и там есть отслежка переходов по времени, ip).
Регистрируетесь и создаете линки (при этом имеете статистику переходов). Если вдруг необходимо изменить ссылки на сайте (например, программа обновилась - изменилась ссылка на скачивание), то меняете конечную ссылку на скачивание в сервисе сокращения ссылок, а на сайте ссылку с сервиса сокращения менять не придется. Плюс к тому если вдруг где проспамитесь ссылочками с сервиса сокращения ссылок, есть всегда возможность обновить конечную ссылку без всяких потерь.
Кстати, этот способ не будет брать лишнюю нагрузку на хост.
Тогда сделайте так..
Скиньте этот файлик в корень сайте http://rghost.ru/46805066, после же перед внешними ссылками вставляете след. код: http://ваш_сайт/ref.php?link=