ну разница как бы есть. Если шаблон не уникален, то пользователь, который уже видел похожий сайт с таким же стилем просто пройдет мимо если сайт был г...
Но т.к шаблонов очень много, то не факт что может попасться одинаковый одному и тому же пользователю. Ну а про остальные минусы я не знаю
Мне как кажется, то у неуникальных шаблонов минус в том, что надо обязательно оставлять ссылку на создателя шаблона, дабы не нарушать авторское право. Но оставляют ссылки некоторые