В первую очередь подозревайте программы, которые могут блокировать буфер обмена в целях защиты от копирования (электронные книги, например). Попытайтесь вспомнить, как давно проблема имеет место и какое ПО вы устанавливали до появления проблемы, потом удаляйте/отключайте подозреваемые программы по одной и проверяйте.