Если фавикон находится в корневом каталоге, то помогать Яндексу не нужно.
Индексация фавикона, соразмерна по времени с индексацией страниц и на новом сайте может занять около месяца.
У меня фавикон засветился в поиске на третий день Тут все зависит от самого сайта. Чем чаще он наполняеться контентом тем чаще роботы ходят на него в том числе и роботы отвечающие за все картинки сайта включая фавикон!